В соответствии с п. 3 ст. 362 Налогового кодекса РФ прекращение исчисления транспортного налога осуществляется в случае снятия транспортного средства с регистрации (снятия с учета, исключения из государственного судового реестра и т.д.).
В силу ч. 4 ст. 80 Федерального закона № 229-ФЗ "Об исполнительном производстве" арест имущества должника включает запрет распоряжаться имуществом, а при необходимости - ограничение права пользования имуществом или изъятие имущества.
Таким образом, исходя из сути данной меры принудительного взыскания, сам по себе арест транспортного средства без его изъятия и принудительной реализации не влечет прекращение права собственности на него. Соответственно, при таких обстоятельствах, обязанность по уплате транспортного налога сохраняется.